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Surveillance septennale des isolats de pharyngite streptococcique du groupe A pédiatrique en Amérique du Nord

Contexte La surveillance du type streptocoque du GAS emm de streptocoque améliore la compréhension de l’épidémiologie de la pharyngite et de la maladie invasive à SGA et la formulation de vaccins multivalents spécifiques au type En outre, cette surveillance fournit des données de base sur le vaccin pré-SGA. Répartition des types d’isolats pharyngés pédiatriques prélevés systématiquement aux États-Unis et au Canada. Méthodes Nous avons recueilli chaque année des isolats de pharyngite aiguë du SAP chez chacun des sites très dispersés aux États-Unis et au Canada pour les enfants d’âge scolaire. a évalué le type et le sous-type d’emm par séquençage de l’ADN et analysé les tendances temporelles et géographiquesRésultats Un total d’isolats US et canadiens ont été étudiés Les types d’emm’s les plus prévalents dans l’ordre décroissant étaient,,,, et aux États-Unis et,,,,, et au Canada, constituant% -% d’isolats dans chaque pays; Les types d’emm constitués% -% total Cinquante-six types d’emm ont été identifiés aux États-Unis, y compris de nouveaux types et types au Canada Bien que quelques types prédominent à l’échelle nationale, une variabilité marquée entre les sites individuels et aux sites individuels d’année en année – Les différences canadiennes dans la répartition des types étaient apparentes Vingt pour cent des isolats représentaient des sous-types d’emm qui différaient légèrement des types de référence; Bien que la distribution globale du type d’EMM aux États-Unis et au Canada soit constante et que peu de types dominent à l’échelle nationale, des variations intersite et temporelles frappantes ont été observées au sein des sites individuels dans les types de SMA les plus répandus. Ces résultats avoir des implications importantes pour le développement et la formulation de vaccins anti-SGA spécifiques au type

Nous avons établi un système de surveillance nord-américain pour la collecte systématique d’isolats streptococciques du streptocoque A du groupe pharyngé aigu chez les enfants dans le but principal d’évaluer le type et la distribution des sous-types d’organismes responsables de la pharyngite pédiatrique. , qui est en grande partie responsable de l’immunité spécifique au SGA Nous avons déjà rapporté des données emm provenant de sites américains de décembre à mai et de sites canadiens et américains de décembre à mai Les principaux types de GAS emm étaient similaires dans les années d’étude Nous présentons des années de données de surveillance – provenant de sites canadiens dispersés et très dispersés sur le plan géographique afin de caractériser plus complètement les tendances temporelles et géographiques et de comparer les distributions de type et de sous-type emm aux États-Unis et au Canada. des sites

Méthodes

Sujets et spécimens Nous avons recueilli des échantillons de pharynx GAS chez des enfants de 5 ans présentant des pharyngites aiguës dans des sites de soins primaires et un laboratoire en Californie répartis dans plusieurs bureaux et sites canadiens à Vancouver, en Colombie-Britannique, à Montréal, au Québec. Chaque pépinière a eu des périodes de collecte dans chaque saison de pharyngite à SGA de décembre à mai, et chaque site a fourni des échantillons par saison. Des prélèvements de gorge ou des plaques de culture ont été expédiés au Laboratoire des maladies infectieuses de l’Hôpital Memorial. , où des isolats ont été confirmés comme SGA par des techniques standards avec confirmation par agglutination avec PathoDx Remel Des gabarits d’ADN de GAS ont été préparés et expédiés au laboratoire de recherche sur les streptocoques du CDC, où ils ont été typés par séquençage en chaîne par polymérase produits générés par la technologie standard niques , et les sous-types ont été assignés comme décrit précédemment en utilisant la base de données de séquences CDC emm http: // wwwcdcgov / ncidod / biotech / strep / strepblasthtm Les spécimens ont été identifiés uniquement par âge et sexe et par date et lieu d’acquisition. approuvé comme étude exemptée par le Children’s Memorial Hospital Institutional Review Board

Résultats

Données cumulatives par pays Le nombre d’organismes recueillis par site dans chacune des années de surveillance américaines et canadiennes est indiqué dans le tableau A total des isolats américains et des isolats canadiens inclus dans cette étude. Le tableau donne les proportions des types d’emm’s les plus répandus aux États-Unis. États et Canada pour chacune des années d’étude et pour toute la période étudiée Un total de différents types d’emm ont été isolés aux États-Unis et au Canada pendant l’étude Huit nouveaux types provisoires ont été trouvés parmi les isolats américains, représentant des isolats individuels. les proportions cumulées d’isolats pour chaque pays pendant toute la période d’étude

Tableau View largeTélécharger la distribution géographique des streptocoques du groupe A View largeTélécharger la distribution géographique des streptocoques du groupe A

Vue de la figure grandDownload slideUS pharyngeal groupe A streptocoques emm types pour les années d’étude -, – n = “Autres” indique emm types avec & lt; isolates eachFigure View largeDownload slideUS groupe pharyngeal A types de streptocoques emm pour les années d’étude -, – n = “Autres” indique les types emm avec & lt; isole chaque

ad slide Groupe pharyngien canadien A types de streptocoques A pour les années d’étude -, – n = “Autres” indique les types d’emm avec & lt; isolates eachFigure View largeDownload slideCanadian pharyngeal groupe A types de streptocoques emm pour les années d’étude -, – n = “Autres” indique les types emm avec & lt; isole chacunIl est évident que les distributions des types de SGA pharyngés les plus prévalents étaient semblables aux États-Unis et au Canada, avec les types d’emm,,,,, et emm et étaient égaux en nombre prédominant au Canada et types emm,,, , et, aux États-Unis, représentant% -% des isolats dans chaque pays tableau et chiffres et Les types les plus répandus emm dans chaque pays représentaient% -% du total Près de la moitié des cas de pharyngite sont causés par emm types, et chaque année dans chaque pays Cependant, on a observé des différences importantes d’une année à l’autre dans la distribution nationale des types d’emm, qui sont visibles dans le tableau. Par exemple, les proportions d’isolats canadiens de type emm varaient de un pourcentage élevé de% dans les différentes années d’étude, type US emm de% à%, isolats américains de type emm de% à%, et type canadien d’emm de% à% tableau différences canadiennes-américaines Malgré la similitude globale des données nationales pour les plus courantes types emm , il est évident que la distribution d’un certain nombre de types d’emm différait significativement entre les pays. Tableau Les données des années – sont données dans ce tableau parce que ce sont les années où nous avons recueilli les données les plus complètes au Canada. Les différences entre les États-Unis et le Canada quant aux proportions d’isolats de type emm et d’emm sont particulièrement frappantes. Variabilité géographique Malgré le degré élevé de similarité des distributions de type emm dans les pays considérés comme significativement plus fréquents. Par exemple, durant l’année, le type d’EMM était très répandu dans certains sites au Dakota du Sud, au Connecticut et en Floride, moins prévalents dans d’autres% au Québec,% dans Pennsylvanie,% à Washington, et% en Californie, et peu fréquent sur les autres sites% dans l’Utah,% en Nouvelle-Écosse et% en Illinois pendant cette saison Variabilité similaire y était apparent pour le type d’emm, qui était le plus répandu en Pennsylvanie% et en Utah% mais pas parmi les meilleurs ou les types du Connecticut%, du Dakota du Sud%, du Québec% ou du Washington% pendant la même saison. et variabilité intersite marquée Une variabilité similaire de la prévalence de types d’emm spécifiques a été observée durant chacune des années étudiées. Les extrêmes de prévalence des types les plus communs dans tous les sites pendant les années étudiées comme% en Nouvelle-Écosse et% en Floride pour emm type,% en Utah et% au Connecticut pour le type emm, et% au Dakota du Sud et% au Dakota du Sud pour emm type dans une année différente mettent en évidence le grand degré de variabilité des types les plus répandus pendant notre période d’étude. En plus de la variabilité intersite saisissante de la distribution de type emm dans une saison donnée, nous avons observé une variabilité année-année marquée dans la distribution de type emm sur des sites individuels, comme en témoigne l’analyse de la plus grande prévalence. par exemple, emm était très répandue chaque année, mais il y avait une variabilité impressionnante des types d’emm,,,,, et d’année en année au cours de l’étude Au cours de cette étude, de nouveaux sous-types, ou variants alléliques, ont été identifiés. Nous avons observé une variabilité considérable entre les types d’emm’s les plus répandus aux États-Unis et au Canada en ce qui concerne la diversité des espèces. sous-types d’emm Dans le type d’emm,,, et les souches, il y avait un grand nombre de variantes, avec – sous-types chacun, représentant% -% de tous les isolats d’un type emm donné Autres types communs,,,,, et montraient peu ou pas une telle diversité, avec seulement – sous-types chacun Types rhumatogènes Les types rhumatogènes classiques de GAS,,,,,, et compris% d’isolats pharyngés américains et% d’isolats canadiens dans cet ensemble de données Cette constatation est cohérente avec notre rapport précédent que ces types rhumatogènes comprenaient% d’isolats de gorge à Chicago pendant -, quand le rhumatisme articulaire aigu était commun, mais ont été trouvés dans un P & lt; Ces dernières années, lorsque la fièvre rhumatismale est devenue inhabituelle en Amérique du Nord Types de vaccins Nous avons évalué la proportion d’isolats pharyngés américains et canadiens inclus dans le vaccin candidat-protéine M valide Environ% d’isolats pharyngiens dans les deux Les types d’emm inclus dans ce vaccin candidat étaient les plus répandus. Le type d’EMM le plus important non inclus dans le vaccin était EMM, qui représentait% de l’aire de répartition annuelle,% -% de l’aire de répartition américaine et% de pharyngite streptococcique canadienne.

Discussion

il s’agit du quatrième type d’EMR le plus répandu, représentant% des isolats américains et% des isolats canadiens. La possibilité que l’utilisation d’un vaccin à base de protéines M puisse mener au remplacement du sérotype, comme on l’observe avec un vaccin conjugué contre le pneumocoque , doit être considérée Cependant, la maladie de remplacement du pneumocoque est encore modeste, avec une incidence globale d’infection invasive chez les enfants pendant des années de vaccination nettement réduite par rapport aux vaccins pré-conjugués . Nos données montrent clairement une variation géotemporale frappante chez les types pharyngiens. Bien que les répartitions cumulatives entre les États-Unis et le Canada soient similaires, il y a eu des variations intersite saisissantes au cours d’une saison donnée et une variation intrasite d’une saison à l’autre. variation, ce qui entraîne une diminution de la prévalence de Nous avons également signalé que plusieurs des types d’EMM les plus courants représentent une proportion progressivement plus faible d’isolats pharyngés chez les enfants plus âgés et les adolescents que chez les jeunes enfants, suggérant un rôle pour l’immunité spécifique au type . de ce concept, récemment Jaggi et al ont rapporté que les taux d’anticorps sériques à plusieurs protéines M communes étaient plus élevés chez les enfants plus âgés que chez les enfants plus jeunes.Les données de type nord-américain emm confirment et étendent notre observation précédente. ,,, et ont nettement diminué dans la prévalence, et dans certains cas complètement disparu, comparé à leur prévalence parmi les types pharyngiens circulant dans les s lorsque la fièvre rhumatismale aiguë était une maladie pédiatrique commune Des isolats pharyngés dans cette étude, seulement type emm, type emm, pas de type emm, et les isolats de type emm ont été récupérés En outre, emm types,, et constitué seulement%,%, et%, respectivement La diminution de la prévalence de ces types rhumatogènes classiques et la quasi-disparition de certains types d’Amérique du Nord sont directement parallèles à la diminution marquée de l’incidence. En général, nous avons observé beaucoup plus de variations de sous-type parmi les souches connues pour ne pas exprimer le facteur d’opacité phénotype OF-positif. Cette constatation est cohérente avec le nombre de sous-types connus dans la base de données “Ou” OF-emm types “voir ftp: // ftpcdcgov / pub / infectious_diseases / biotech / tsemm / pour une compilation totale de sous-types Les types emm avec une diversité limitée expriment tous OF, le produit du gène sof, alors que les types très divers sont de type négatif Traditionnellement, les types rhumatogènes sont sof négatifs, tandis que les types séronégatifs sont considérés comme capables de causer à la fois une infection de la peau et du pharynx plutôt que la peau ou le ph. Infection aryngée et non-rhumatismale Par exemple, les types EMN-négatifs,, et, par ordre décroissant de prévalence parmi les isolats US de pharyngite, sont associés respectivement à,,, et sous-types connus Note que le type emm est phénotypiquement négatif mais sof positif, contenant un gène sof de pleine longueur, qui est défectueux à cause d’une seule détection de base En revanche, les types communs de type EM, type emm, type d’emm et type d’emm ne comptent que,, , et les sous-types connus, respectivement Les raisons pour lesquelles les types d’EMN négatifs sont associés à plus de sous-types ne sont pas entièrement comprises; Il est concevable que ces observations reflètent une plus grande pression immunologique exercée sur eux. Cependant, dans le cas du type emm, il est apparent que les répétitions tandem adjacentes chevauchent la région déterminant le sous-type de base, et les mésappariements intragéniques résultants conduisent à un nombre relativement grand. de sous-types B Beall, données non publiées La plupart des sous-types ne représentent que quelques substitutions d’acides aminés, et nous avons montré que, pour plusieurs types négatifs avec de nombreux sous-types, ceux testés étaient encore opsonisés par des antisérums spécifiques. En outre, l’évaluation des sous-types fournit un marqueur de la souche qui peut être utile pour évaluer les associations épidémiologiques entre les isolats cliniques de GASThe les données obtenues au cours de notre GAE multisite US et canadien. étude de surveillance de la pharyngite pédiatrique démontrent que la distribution de type emm était plutôt cohérente lorsque vue nation On a souvent observé des différences intersites significatives entre les types d’emm prévalents et les différences temporelles au sein des sites individuels au cours de la surveillance. Un vaccin expérimental-valent-protéine M couvrait ~% des isolats pharyngiens dans chaque pays, avec emm tapez le type le plus répandu non inclus dans le vaccin

Groupe de surveillance de la pharyngite streptococcique de l’Amérique du Nord

Richard Nachman et Teresa Rhim, Chicago, Illinois; Edward Rothstein, Sellersville, Pennsylvanie; Thomas Zavelson et John Hellrung, Gainesville, Floride; Andrew Gellady, à New Port Richey, en Floride; Roopal Patel, Tampa, Floride; Cathy Hofer, Chris Tiongson, Rich Kooima et Michael Elliott, Sioux Falls, Dakota du Sud; Heather Christianson, Mitchell, Dakota du Sud; Marcene Bloom, Rapid City, Dakota du Sud; S Michael Marcy et Emily Chang Wong, Panorama City, Californie; Susan Novak-Weekley et Anne Vannier, North Hollywood, Californie; Jon Almquist, Federal Way, Washington; Delbert Hodder, Bristol, Connecticut; John Ledbetter et Tracey Stewart, Little Rock, Arkansas; Paige Suffredini, Austin, Texas; Julie Gustin et Tiffany Glasgow, Sandy, Utah; Jane McDonald, Montréal, Québec; Scott Halperin et Annette Morris, Halifax (Nouvelle-Écosse); et Annette Castell et Laura Book, Vancouver (Colombie-Britannique)

Remerciements

Conflits d’intérêts potentiels STS a reçu un soutien de recherche d’ID Biomedical et des frais de conférence par Pfizer, Wyeth, Abbott et Glaxo-Smith Kline JBD est l’inventeur de certaines technologies liées au développement des vaccins anti-SGA, y compris le vaccin -valent fait l’objet d’essais cliniques; et a servi comme consultant pour ID Biomedical, qui a partiellement financé cette étude Tous les autres auteurs: pas de conflits