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Emerging Norovirus GII à Taiwan

A l’éditeur-norovirus humains, les NOV sont l’un des agents responsables de la gastro-entérite aiguë dans le monde entier. Parmi eux, le génotype de NoG genogroupe II GII a été la principale cause d’AGE associée à NoV À Taiwan, NoV GII a provoqué plusieurs foyers En revanche, NoV GII est considéré comme un génotype rare pour l’infection humaine Ce génotype a été signalé pour la première fois en Afrique et en Amérique du Sud et a récemment été identifié comme une souche d’épidémie au Japon et en Chine Ici, nous rapportons des cas d’infection NoV GII détectés à Taïwan et comparons leurs séquences génomiques avec celles d’autres régions du monde. C’est le premier rapport de GII à Taïwan. En janvier, une jeune fille a été admise à l’hôpital Chang Gung pour enfants lexingtonlaserspa.com. traitement en raison de l’apparition soudaine d’une douleur abdominale, accompagnée de vomissements violents et d’une déshydratation sévère. Il n’y avait pas d’antécédents de voyage L’analyse des selles a montré la présence d’occul Elle a bien récupéré en quelques jours Un mois plus tard, en février, une fillette qui avait une diarrhée aqueuse aiguë, des vomissements sévères avec un contenu bilieux. Des symptômes gastro-intestinaux similaires ont également été observés chez les membres de la famille, et tous ont mangé la même nourriture dans un marché de nuit au lac Fen-Chi. région, Chia-Yi L’analyse des selles était positive pour le sang occulte et le test RT-PCR NoV Après hydratation et traitement médical, elle a récupéré sans incident en quelques jours Des échantillons fécaux ont été prélevés chez ces patients après obtention d’un consentement éclairé Institutional Review Board -A et l’ARN a été extrait en utilisant QIA Viral RNA Mini Kit Qiagen, Venlo, Pays-Bas NoV génome a été amplifié en utilisant RT-PCR avec des amorces spécifiques, le numéro d’accession des isolats GII ont été KR et KR dans GenBank Les arbres phylogénétiques basés sur le VP capside et les séquences du génome complet ont été construits en utilisant la version logicielle de MEGA L’arbre VP a divisé les isolats GII en grappes comme révélé dans une étude précédente Dans le même groupe, il y avait des isolats de Chine, du Japon, du Cameroun et du Kenya. Les isolats du groupe B présentaient des sources géographiques beaucoup plus diverses, couvrant l’Afrique, l’Europe, l’Asie de l’Est et l’Amérique du Nord et du Sud. Premièrement, les voyages mondiaux ont été de plus en plus fréquents, avec lesquels le virus GII s’est propagé dans le monde entier. Deuxièmement, GII existe partout dans le monde à l’origine, et a progressivement émergé Nous sommes enclins à la seconde hypothèse, parce que les patients et leurs voisins dans le présent rapport n’ont pas d’histoire de voyage en Afrique

Figure Vue largeDisque de téléchargement Arbre généalogique calculé sur la séquence nucléotidique de la séquence partielle du gène VP A et de la séquence génomique complète du norovirus B Les échantillons sont marqués d’un cercle noir La barre d’échelle indique le nombre de mutations par position de séquence représentent le pourcentage de rééchantillonnages bootstrap Les séquences de référence ont été sélectionnées sur la base des rapports précédents et présentées comme des numéros d’accession GII est utilisé comme outsgroupFigure View largeTélécharger une diapositivePhylogénétique analysée basée sur la séquence nucléotidique de la séquence partielle du gène VP A et du norovirus humain Séquence complète du génome B Les échantillons sont marqués d’un cercle noir La barre d’échelle indique le nombre de mutations par position de séquence Les nombres aux nœuds représentent le pourcentage de rééchantillonnages bootstrap Les séquences de référence ont été sélectionnées sur la base des rapports précédents est utilisé comme groupe externe Dans l’arbre du génome complet, t Figure B En raison de la rareté des données de la séquence du génome complet, le groupe B ne contenait qu’un numéro d’accession d’isolat KC Un événement de recombinaison intéressant a été détecté dans l’isolat GII des États-Unis Bien qu’il soit classé en GII par le VP L’ensemble du génome de NoV est composé de gènes, c’est-à-dire de POL, de VP et de VP. Une analyse BLAST détaillée sur les gènes VP et VP a montré que l’arbre basé sur le génome complet était relativement proche de GII. que cet isolat des États-Unis est un GII typique, alors que son gène POL a une identité de nucléotides de>% avec GII En d’autres termes, cet isolat était un recombinant entre GII et GII typiques; le point de rupture exact de la recombinaison était entre POL et VP. On ignore si cet événement de recombinaison confère un avantage spécial à la forme de la NO. Néanmoins, nos résultats suggèrent que pour obtenir des informations de génotypage précises, une analyse basée sur le génome viral complet. En conclusion, cette étude a rapporté l’émergence d’un nouveau NoV GII causant l’AGE à Taïwan. Les manifestations cliniques étaient généralement les mêmes que celles provoquées par GII. Bien que moins largement signalé, NoV GII aurait pu exister dans le monde entier. Des événements de recombinaison pourraient survenir entre GII et les autres génotypes GII Une surveillance continue est nécessaire

Remarques

Soutien financier L’étude a été financée par des subventions de l’hôpital Chang Gung Memorial CMRPGC et ministère des Sciences et Technologies – B–, Taiwan Conflits d’intérêts potentiels Tous les auteurs: Aucun conflit signaléTous les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits potentiels de conflits d’intérêts que les éditeurs jugent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués