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Virus de l’immunodéficience humaine plasmatique faiblement ou indétectablement indétectable par le VIH, déterminé par la réaction en chaîne de la polymérase, chez des patients ouest-africains et américains atteints d’une infection par le VIH de sous-type

La réaction PCR en chaîne du virus de l’immunodéficience humaine plasmatique VIH-ARN ribonucléique quantifie insuffisamment la charge virale de certains sous-types non-B du VIH en raison de la diversité génétique dans la région gag ciblée par les amorces de PCR ARN-VIH plasmatique étonnamment faible ou indétectable les découvertes par PCR étaient un indice des infections au VIH non B chez les patients chez lesquels l’ARN du VIH plasmatique était significativement plus élevé quand il était déterminé par un dosage de l’acide désoxyribonucléique à chaîne ramifiée

La diversité génétique est un attribut quintessenciel du VIH de type VIH- A l’échelle mondiale, le VIH existe dans une variété de souches génétiques, appelées “clades” ou “sous-types”. Les séquences génétiques des sous-types diffèrent les unes des autres de ~% dans l’env. région qui code l’enveloppe externe et par ~% dans la région gag qui code pour une protéine structurelle interne La plus grande diversité génétique existe en Afrique centrale, où l’on pense que le VIH est originaire Tous les sous-types connus sont présents en Afrique Sous-type B VIH-, domine parmi les infections acquises en Europe et aux Amériques, est numériquement insignifiant en Afrique La quantification virale au moyen de la transcriptase inverse-PCR L’analyse RT-PCR repose sur la détection et l’amplification d’une seule séquence génétique virale conservée. un impact négatif marqué sur la capacité du test à quantifier le virus. Le test RT-PCR approuvé pour une utilisation clinique par la Food and Drug Administration des États-Unis; La version Amplicor MONITOR de Roche amplifie une séquence -bp en utilisant une seule paire d’amorces SK / SK et une sonde SK Elles se lient à une région conservée de la séquence du gène HIV-gag dérivée de sous-type BS études en laboratoire montrent que ce test de RT-PCR quantifie insuffisamment de nombreux virus des sous-types A et E en raison des mésappariements entre les amorces et les régions dans lesquelles ils s’hybrident au gag du sous-type A Sous-type E, un virus recombinant contient le gag du sous-type A Bayer Diagnostics détecte le VIH par hybridation à de multiples séquences, dérivées de multiples sous-types, qui couvrent presque toute la longueur -bp du gène pol polymérase On pourrait prédire que la variation génétique aurait moins d’impact sur un test utilisant plusieurs séquences conservées Bien que les deux tests soient linéaires sur leurs plages dynamiques déclarées pour le sous-type B, le test RT-PCR aboutit à une détermination de la charge virale pour le sous-type B nsistently log plus haut que celui trouvé par l’utilisation du test d’ADNb quand les essais sont directement comparés Cependant, le test d’ADNb est mieux capable de quantifier les sous-types A et E que le test RT-PCR approuvé par la FDA pour les sous-types A et E, La charge virale déterminée par le test bDNA est supérieure à celle trouvée par le test RT-PCR Un test RT-PCR en développement utilisant des amorces supplémentaires La version Roche Amplicor MONITOR a été rapportée pour mieux quantifier les sous-types A et E [ -] Le sous-type A est le sous-type dominant>% en Afrique de l’Ouest Le sous-type E est présent dans certaines parties de l’Asie, en particulier la Thaïlande Dans une clinique du Bronx, New York, étonnamment faible ou indétectable Des copies / mL de charges virales mesurées par le test RT-PCR MONITOR approuvé par la FDA ont été notées chez des patients qui étaient des immigrants récents en provenance d’Afrique de l’Ouest. Les immigrés ouest-africains représentent ~% d’une population clinique. Le test PCR et le test ADN b, à notre connaissance, les cas détaillés ici sont les premières descriptions de patients identifiés dans le contexte de soins cliniques dont les charges virales étaient faussement ou indétectables par le test RT-PCR en raison de la présence de Infection par le VIH non B Les patients avaient un nombre de cellules CD en baisse pendant le traitement antirétroviral ART, malgré des charges virales indétectables répétées, comme le montre le test RT-PCR, ou ils avaient des charges virales indétectables lorsqu’ils n’étaient pas sous TAR.

B VIH-; sa charge virale était de copies / mL RT-PCR comparé à, copies / mL test d’ADNb pendant l’ART Ni lui ni ses partenaires sexuels n’avaient voyagé à l’étrangerPatient a demandé un test VIH après avoir appris que son seul partenaire sexuel de & gt; des années étaient mortes d’un SIDA de longue date Son nombre initial de cellules CD était de cellules / mm, et sa charge virale était à plusieurs reprises indétectable test RT-PCR, & lt; copies / mL alors qu’il n’était pas sous traitement antirétroviral Il avait un VIH non B-; La charge virale évaluée par le test d’ADNb était de: copies / mL, alors que sa charge virale était de copies / mL évaluée par le test RT-PCR. Rétrospectivement, son partenaire, patient, qui avait fréquenté la clinique régulièrement pendant des années, avait étonnamment Elle a eu une relation antérieure avec un homme d’Afrique de l’Ouest Elle a peut-être contracté une infection au VIH de sous-type A chez son partenaire ouest africain et l’a transmise à son partenaire né à New York. Patient, homme homosexuel de New York, présentant une candidose œsophagienne Avant l’ART, son compte de cellules CD était de cellules / mm, et sa charge virale était de copies / mL RT- Test PCR Lors d’une évaluation ultérieure, sa charge virale était de copies / mL par le test RT-PCR et, copies / mL par le test ADNb avant ART Il avait aussi une infection par le VIH non-B Ses contacts sexuels ont eu lieu à New York avec des hommes qui n’avaient pas voyagé à l’étranger De plus, le test de RT-PCR et le test d’ADNb doivent systématiquement mesurer la charge virale chez les patients susceptibles d’être infectés par des sous-types VIH non B, notamment les immigrants d’Afrique et les patients dont la faible charge virale semble incompatible avec leur statut clinique Quatre patients nouvellement diagnostiqués d’Afrique de l’Ouest ont démontré des différences substantielles dans la charge virale lorsqu’ils ont été testés par RT-PCR et les tests d’ADNb à l’entrée ou peu après l’entrée dans la clinique Patiente, originaire du Bénin Bien que sa charge virale telle qu’évaluée par le test RT-PCR ait été substantielle, elle était presque plus élevée lorsqu’elle était évaluée par le test d’ADNb. La charge virale extrêmement élevée était compatible avec elle. symptômes avancés De façon surprenante, le test sérologique du sous-type a révélé un sous-type B Une caractérisation plus approfondie par un test de mobilité hétéroduplex a également classé le virus s sous-type B sur la base des séquences env et gag M Gorny, communication personnelle Aucun génotypage de confirmation n’a été fait à ce jourPatient, du Mali, avait une infection à VIH nouvellement diagnostiquée pendant la grossesse Sa charge virale répondait favorablement à l’ART, avec une baisse de, à ; copies / mL test RT-PCR, mais il était encore en copies / mL quand il était évalué par le test bDNA Patient ivoirien asymptomatique lorsqu’il se présentait pour un test de routine VIH De plus, un patient, du Ghana, était suivi en clinique avec Des tests d’ADN bRNA et de RT-PCR ont montré que la charge virale initialement indétectable était palpable chez le patient recevant un TAR epilepsie : les différentes formes chez l’enfant. Pour cette patiente, une percée virologique a été démontrée à plusieurs reprises seulement avec un test d’ADNb, car les résultats du test RT-PCR restaient indétectables. l’étude dont les charges virales étaient détectables par RT-PCR, les résultats de la RT-PCR étaient comparables aux résultats de l’ADNb, avec les résultats de la RT-PCR uniformément un peu plus élevé différence moyenne, log; range, – log Ainsi, la sous-quantification de la charge virale par le test RT-PCR n’est pas invariable chez les patients infectés par le VIH non-B- Pour tous les patients avec des charges VIH détectables pour lesquelles des comparaisons répétées ont été effectuées, Les résultats d’ADNb ont été trouvés, l’anomalie a été démontrée à plusieurs reprises. Il semble improbable que l’erreur systématique de laboratoire sous-estime la charge virale par RT-PCR dans certains cas mais donne une valeur légèrement plus élevée dans d’autres cas. Charge virale Toute circonstance compromettant la fiabilité de la mesure de la charge virale a un impact négatif sur les soins aux patients infectés par le VIH. Le test RT-PCR approuvé par la FDA répond mal aux besoins des patients infectés par le VIH de sous-type A ou E. souffrent le plus souvent de personnes vivant hors des frontières des États-Unis, de telles infections se rencontrent aux États-Unis, même chez les personnes qui ont acquis Infection par le VIH localement Les populations se mélangeant, la propagation de l’infection par le VIH non B aux États-Unis peut être anticipée, en particulier dans les villes à forte population immigrante. Lorsqu’un patient infecté par le VIH a une charge virale étonnamment faible évaluée par RT-PCR test, il serait prudent de considérer la possibilité d’infection avec un sous-type non-B Le test d’ADNb, qui présente des caractéristiques mieux adaptées à la diversité virale dans le gène pol, ou la version d’essai de Roche Amplicor MONITOR être utilisé dans cette situation

Reconnaissance

Bayer Diagnostics a effectué les tests d’ADNb chez des patients identifiés avec des non-B VIH-